赣榆中专学校高职设置15个系(院)部，医药卫生学院(下设护理系、中药与医学技术系)、电大工作部、中专部、五年制专科(中专)部、航空学院、汽车学院、机电工程系、经济管理系、艺术系、建筑工程系、思政教学部、公共教学部、成人教育学院。开设护理、中药、医学影像技术、建筑工程技术、工程造价、会计电算化、旅游管理、机电一体化技术、机械设计与制造、汽车检测与维修技术、汽车技术服务与营销、航空机电设备维修、飞行技术、航空服务、音乐表演、装潢艺术设计等37个专业。中专开设护理、中医、中药、中医康复保健、中餐烹饪、数控技术应用、戏曲表演等54个专业。汽车检测与维修和机电一体化两个专业被教育部、财政部确定为中央财政支持项目，机电一体化专业被确定为江苏省专业综合试点项目，护理专业被确定为江苏省高职教育特色专业。建筑工程技术实训基地为江苏省高职教育示范性实训基地建设项目。